Địa ngục xảy ra một sự kiện kỳ lạ, một lượng lớn vong linh biến mất một cách bí ẩn. Tại Bạch Ngọc Lâu, Konpaku Youmu, người chán nản với cuộc sống bình yên thường ngày, đã nhận lời thỉnh cầu của Shiki Eiki Yamaxanadu và chủ nhân của cô, Saigyouji Yuyuko,  đi đến vùng đất Huyễn Tưởng để điều tra nguyên nhân.
Đồng hành cùng cô là Onozuka Komachi, một tử thần lười nhác. Đêm đó, khi đang trên đường tìm Hakurei Reimu, họ bị lũ vong linh tấn công bằng thứ vũ khí kỳ lạ. Tuy kẻ địch đã được giải quyết khi Youmu dùng thanh Bạch Ngọc kiếm, vũ khí gia truyền của gia tộc Konpaku và gặp được Reimu nhưng Reimu cũng không biết chuyện gì đang diễn ra.
Tưởng chừng như mọi chuyện đã bế tắc, Youmu nghe theo lời khuyên của Komachi đến Hương Lâm Đường gặp Morichika Rinnosuke. Sau đó, như suy đoán, một cuộc khủng hoảng đã xuất hiện.